O Programa Apolo utiliza metodologia reflexiva, participativa e responsabilizante, baseada em grupos estruturados de diálogo, desenvolvimento de competências socioemocionais, análise crítica das masculinidades e reconhecimento dos impactos da violência.

As atividades articulam experiências pessoais, situações do cotidiano, exercícios reflexivos e estratégias práticas para favorecer a autorregulação, a comunicação não violenta, a resolução de conflitos e a construção de relações mais respeitosas.